Содержание
Пептиды - это фрагменты коротких полимеров, состоящих из аминокислот. Каждый пептид имеет определенную последовательность аминокислот, обозначенную трехбуквенным кодом или только одной; например, аминокислота аланин сокращенно обозначается как «Ala» или «A». Количество пептидов в растворе зависит от его кислотности. Изоэлектрическая точка (pI) относится к значению кислотности раствора, в котором молекула пептида имеет чистый заряд, равный нулю. Растворимость пептида минимальна в изоэлектрической точке. Используйте доступные веб-серверы, чтобы вычислить значение pI для аминокислотной последовательности пептида.
Шаг 1
Последовательность пептида, используя однобуквенный код. Например, если пептид имеет аминокислотную последовательность Ala-Ser-Glu-Leu-Pro (аланин - серин - глутаминовая кислота - лейцин - пролин), то однобуквенная последовательность будет «ASELP». При необходимости обратитесь к таблице преобразования одной буквы в трехбуквенный, представленной в разделе Ресурсы.
Шаг 2
Используйте любой браузер, например Internet Explorer или Firefox, для входа на сервер, который вычисляет изоэлектрическую точку пептида (pI); см. Ресурсы.
Шаг 3
Введите однобуквенную последовательность пептида - в нашем примере «ASELP» - в поле и нажмите «Вычислить».
Шаг 4
Считайте значение изоэлектрической точки (pI), указанное в строке «Теоретический pI / Mw» (теоретический pl). В нашем примере pI равен 4,00. Обратите внимание, что сервер также вычисляет молекулярную массу (Mw) пептида.