Содержание
Скорость мутации - это вероятность того, что нуклеотид будет пропущен или изменен в ДНК, вызванный либо естественными ошибками в обработке ДНК (спонтанная мутация), либо внешними агентами (индуцированная мутация). Эту скорость не следует путать с частотой мутации, то есть количеством случаев мутации в данном поколении. Частота мутаций для определенного вида обычно экстраполируется из данных, сравнивая все последовательности ДНК в поперечном сечении видов с последовательностями их потомков. В лаборатории это обычно делается путем выделения образца видов и предоставления им возможности размножаться в течение нескольких поколений.
Расчет частоты мутаций вида
Шаг 1
Чтобы облегчить этот процесс, возьмите группу образцов гермафродитов (которые оплодотворяют собственные яйца и не нуждаются в партнерах), которые быстро размножаются и для которых вы можете воспроизвести условия жизни в лаборатории. Caenorhabditis elegans - это небольшой вид круглых червей, который соответствует этим критериям и ранее был протестирован на частоту мутаций.
Шаг 2
Последовательность и запись ДНК вашего вида.
Шаг 3
Изолируйте как можно больше особей разных видов, чтобы вы управляли ими, содержали их и наблюдали в течение длительного периода времени в условиях, при которых это существо, как известно, процветает. Это минимизирует эффект естественного отбора за счет уменьшения вашего генетического образца.
Шаг 4
Для каждого поколения видов держите только одно потомство.
Шаг 5
Позвольте как можно большему количеству поколений возникнуть и умереть, точно отмечая, сколько поколений прошло для каждой линии.
Шаг 6
Возьмите случайный или полный образец ДНК вашего последнего потомства и сравните его с последовательностью исходного вида. Подсчитайте количество изменений.
Шаг 7
В конце эксперимента используйте следующее уравнение для расчета скорости мутации для вашего вида: µ = m / (L x g x b)
где: µ = частота мутаций m = количество наблюдаемых мутаций L = количество экспериментальных штаммов g = среднее количество поколений b = количество секвенированных пар оснований